Perdona, ya di por hecho que sabías lo que era el MRD, porque tu mismo dijiste que tu antena incorpora uno:
Antena TDT - UHF DAT HD 75 Boss Tech MRD inteligente 19 dB Televes
Es el amplificador integrado en la misma antena. Ese amplificador si funciona bien no tiene en principio peligro de saturarse y dar problemas ya que se autoajusta. Para que funcione tienes que conectar la fuente a la antena y si no lo alimentas creo que deja pasar la señal sin amplificarla. Entonces como te ha dicho CristobalH tienes que quitar el amplificador tuyo pero dejar la fuente conectada a la antena.
Tiene pinta que tu problema es que recibes algunos canales con mucha potencia y otros con muy poca. En pueblos estos días es común, recibes los canales "principales" del repetidor local del pueblo y los "secundarios" de algun emisor más lejano, eso cuando se reciben según propagación.
Para darle una solución adecuada al problema deberías descubrir o informarte desde donde se emite cada canal que recibes. Ya que te interesa recibir los canales secundarios quizá podrías orientar la antena un poco más hacia el emisor que los emite y alejar la antena del repetidor local, esto te permitiría igualar un poco más las señales para evitar saturar el amplificador.
La otra solución seria instalar una central programable o módulos monocanal que te permitirían igualar las señales que recibes, pero es una solución costosa. Ten en cuenta además que los canales secundarios que no se emiten por el repetidor local quizá no es posible recibirlos en condiciones durante todo el día.